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蝙蝠屋
台灣最多蝙蝠使用的蝙蝠屋（蝙蝠巢箱）
在台灣，自2001年福山植物園架設第一個蝙蝠屋以來，目前在野外至少有20種款式的蝙蝠屋，絕大部分可在黃金蝙蝠生態館發現。其中，運用最好的是這款蝙蝠屋，已至少有12種台灣蝙蝠住進去。這一款蝙蝠屋是張恒嘉老師在2002年開始推廣的款式，也是台灣最常見、最常被仿製、最多環教、館舍、學校、農田及工程營造單位使用的蝙蝠屋。這一款蝙蝠屋曾採用使用台灣國產再生林、FSC認證森林、南洋地區森林的軟、硬木和美洲松杉等材料製作而成。此款蝙蝠屋開發已有20年，中間幾年曾經小幅改款5次，用來改善木材來源的環境友善程度、加強結構、降低非目標物種或增加特定物種的進入，此款蝙蝠屋目前也是亞洲最多種類蝙蝠使用的蝙蝠屋。
蝙蝠屋 【DIY款】Bat House (親子共做適用)
這一款蝙蝠屋是本館2016年推出的DIY款蝙蝠屋，使用台灣國產再生林、FSC認證森林或南洋硬木製作而成。改良自2013年前款不易DIY、屋頂容易漏水、木材厚度及蝙蝠使用空間不足的缺點而製成。
本款組合式蝙蝠屋有5種蝙蝠入住，其中包含國家瀕危的霜毛蝠。2019年12月起，本款已全面改採台灣國產材製作，組合包內有提供中英文繪製安裝與架設的流程建議，比較適合初入門的親子一起DIY，動手做蝙蝠的保育。
蝙蝠屋 【 環保材質款】蝙蝠巢箱
黃金蝙蝠生態館最早從2002年開始採用FSC友善森林認證的林木來製作蝙蝠屋，當時是採用加拿大卑斯省FSC認證森林杉木、德國水性環保膠的夾板來製作，由於製作過程無毒，又可抗潮，材料通過生態綠建材認證，所以我們才引進這款環保夾板來測試其耐用程度。
後來因為國外FSC材料來源取得有問題，而台灣政府開始認真處理國產林木產銷問題，因此我們就順勢改採新竹五峰鄉的FSC友善森林認證杉木。它具備雙層空間，使用不易繡蝕的五金，木材加厚保溫效果更好，曾成功吸引3種蝙蝠入住。
卡榫式蝙蝠屋
這是中原大學商業設計系「好厝蝙 BATiful」團隊彭芮妍、陳思蒨及王晨禹等三人從2016年與黃金蝙蝠生態館合作開發的新式蝙蝠屋，2017年5月正式在台北世貿一館發表。全程採用古老的木工技法榫接技術組合而成，全程不使用任何一根釘子，是最新潮、最方便組合的蝙蝠屋。
本款式蝙蝠屋目前沒有量產，在2018年起由「好厝蝙 BATiful」團隊提供給黃金蝙蝠生態館策展，給所有預約的團客一起分享。
BCI型蝙蝠屋
BCI型蝙蝠屋介紹
Merlin Tuttle博士設計的BCI型蝙蝠屋是美洲地區最暢銷的蝙蝠屋。台灣永續聯盟將BCI單層式蝙蝠屋、BCI多層式蝙蝠屋及BCI火箭型蝙蝠屋全都架設在黃金蝙蝠生態館。單層式蝙蝠屋的蝙蝠製作較簡單，頗適合DIY；多層式蝙蝠屋和火箭型蝙蝠屋的優點是高大多層，可在不同方向的不同隔間內形成不同的微氣候，更能夠吸引大量的蝙蝠長期使用，但缺點則是費時費工、造價貴且不好安裝。
葉棚式蝙蝠屋
台灣最大的蝙蝠屋源自於2016年本館邀請全世界最大蝙蝠保育組織BCI創辦人Merlin Tuttle 來台交流期間的發想，並在2019年2月辦理東南亞蝙蝠聲學座談會，陸續襲取越南與柬埔寨當地的葉棚製作經驗後，由台灣永續聯盟與蘇秦社區發展協會共同設計、尋找、募集所有材料與機具，自行製作完成。
超大型蝙蝠屋座落於黃金蝙蝠生態館所在地，長11~12米，寬4~5米，高7~8米。主架構使用民眾捐贈的美杉，周圍使用再生台灣杉，其內設置約800根棕櫚科植物枯葉叢，主要設計給會棲息在棕櫚科植物的高頭蝠使用。周圍放置約五十個小型蝙蝠屋，目前已有東亞家蝠入住。
台灣第二大的蝙蝠屋
這個蝙蝠屋由台灣永續聯盟架設在黃金蝙蝠生態館館區內，是台灣第二大的蝙蝠屋。具備雙層構造，上層可容納洞穴型的蹄鼻蝠和葉鼻蝠類棲息，下層的隔間眾多，理論上可吸引數萬隻蝙蝠入住。本館占地面積較小，且這座蝙蝠屋為教育展示用途，因而架設在建築物旁、高度也較低。有東亞家蝠和高頭蝠棲息紀錄，高昂的造價比較適合有穩定財源與特殊目的單位來推廣。
